Las misiones prioritarias de la Federación Europea de Ciudades Napoleónicas son:

• la conservación, la puesta en común, la valorización y la salvaguardia del patrimonio cultural común de importancia europea vinculado al mito napoleónico y a la influencia del período napoleónico en la Europa contemporánea;
• sensibilizar al público, poner de relieve la diversidad cultural y promover el conocimiento mutuo de la historia, las raíces y los valores culturales comunes a los pueblos de Europa y su patrimonio cultural común;
• el desarrollo de la investigación, la enseñanza y la difusión del conocimiento.

La FECN desarrolla sus actividades en torno a tres orientaciones principales:

• promover los intercambios sobre la historia napoleónica mediante la organización de encuentros, coloquios y publicaciones en colaboración con universidades, instituciones culturales y asociaciones históricas;
• promover y apoyar la conservación y restauración del patrimonio napoleónico (objetos, obras de arte, mobiliario, monumentos, lugares, etc.);
• desarrollar actividades de promoción y valorización del patrimonio a través de exposiciones, manifestaciones artísticas y visitas de descubrimiento, especialmente en el marco de intercambios turísticos, escolares o universitarios.